Jana Maláčová studovala na Univerzitě Johanna Wolfganga Goetha ve Frankfurtu nad Mohanem a následně London School of Economics and Political Science.
V letech 2007 až 2011 pracovala na ministerstvu pro místní rozvoj jako analytička fondů EU, působila jako zástupkyně Kanceláře Senátu při Evropském parlamentu, či vedla oddělení institucionální komunikace EU Sekce pro záležitosti EU na Úřadu vlády.
Od června 2015 do července 2018 byla ředitelkou odboru rodinné politiky a politiky stárnutí na ministerstvu práce a sociálních věcí.
Je členkou ČSSD, místopředsedkyně spolku Oranžový klub, který kromě toho, že prosazuje spravedlivé zastoupení žen ve veřejném životě, usiluje třeba také o možnost legální asistované reprodukce ženám bez partnera formou darovaného spermatu. Maláčová je i členkou správní rady Česko-německého fondu budoucnosti.
Manželem Jany Maláčové je Aleš Chmelař, státní tajemník pro evropské záležitosti při Úřadu vlády.