S.T.A.L.K.E.R. Clear Sky opravdu je prequelem původní hry, přičemž se bude odehrává těsně před jejím začátkem. Zónou otřásají zvláštní emise, které mění veškeré prostředí kolem sebe. Všechny existující frakce S.T.A.L.K.E.R.ů teď bojují o území, ale každá z jiného důvodu. Hráč se ujme role S.T.A.L.K.E.R.a Jizvy a může se na dobrodružství vydat sám nebo se posléze k nějaké té frakci připojit. Dočkali jsme se možností opravy zbraní, stejně tak jako jejich upgradů. Předělán byl i HUD a PDA. Hra podporuje jak DirectX 9, tak jeho desátou verzi, vylepšený herní engine X-Ray 1.5 a nový engine pro animace.