Michálkovo svědectví rozpoutalo aféru, která stála místo ve vládě ministra životního prostředí a místopředsedu ODS Pavla Drobila. I když ho Drobil ještě před odchodem z vlády odvolal z pozice šéfa fondu, Michálek v SFŽP zůstal jako finanční poradce.
Založením odborové organizace dosáhl toho, že je coby odborový předák prakticky "nevyhoditelný", i když popírá, že to bylo jeho cílem.
Michálek řekl Euru, že ustanovení o ochraně zaměstnanců fondu, kteří upozorní na nečisté praktiky, chce prosadit do kolektivní smlouvy v SFŽP. Zákoník práce to totiž neřeší. Za jedno ze zásadních protikorupčních opatření považují ochranu lidí, kteří něco takového nahlásí, Věci veřejné. Exministr vnitra Radek John to prosadil i do vládní protikorupční strategie.
"Informaci jsem ověřoval na SFŽP a skutečně pan Michálek odbory založil. To je právem každého zaměstnance. A SFŽP i ministerstvo životního prostředí budou i toto respektovat v souladu se zákonem," cituje časopis ministra Tomáše Chalupu z ODS.
Kauzu, která vedla k pádu ministra, rozjel Michálek tajnými nahrávkami
Michálek se snažil korupční poměry na ministerstvu a ve fondu prokázat nahrávkami, které si tajně pořídil. Drobilův tehdejší poradce Martin Knetig na nich popisuje, jak se dostat k penězům na financování další kariéry svého šéfa a ODS.
Michálek pak o svých podezřeních řekl ministrovi a upozornil ho, že má i nahrávku Knetiga. "Pokud máte něco, co má nějakou trestněprávní odpovědnost, tak buď s tím zajděte na nejbližší policii, nebo to zničte," řekl mu Drobil, což si Michálek také nahrál. Nahrávky dal novináři Janku Kroupovi, který vše v MF DNES zveřejnil. S Drobilem se pak premiér Petr Nečas dohodl na jeho odchodu z vlády.
Policie nakonec navrhla postavit před soud jen Knetiga. Podala návrh na obžalobu z nepřímého úplatkářství, kterého se podle ní dopustil při zadávání veřejných zakázek na Státním fondu životního prostředí.
V říjnu 2010 Knetig členovi představenstva Komerční banky sliboval, že zajistí uložení peněz ze Státního fondu životního prostředí na účet u této banky. Za to prý chtěl získat sponzorský dar pro ODS (více zde).
Ředitel Útvaru pro odhalování korupce a finanční kriminality Tomáš Martinec před pár dny v České televizi řekl, že policie je připravena stíhat i Drobila. A to v případě, že dá Nejvyšší státní zastupitelství pokyn k otevření kauzy. Žalobci případ stále kontrolují a prověřují (předchozí vývoj kauzy zde).