Marek Daniel se poprvé ve filmu objevil v oscarovém snímku Kolja (1996). V roce 2009 ztvárnil hlavní roli ve filmu Protektor (2009) za níž byl nominován na Českého lva. Zahrál si i ve filmech Roberta Sedláčka Sráči (2011) a Rodina je základ státu (2011). Objevil se ve filmech Stůj nebo se netrefím (1997), Paralelní světy (2001), Vyhnání z ráje (2001), Divoké včely (2001), Nuda v Brně (2003), Horem pádem (2004), Štěstí (2005) a Doblba! (2005).
Marek Daniel hrál Václava Havla v televizním seriálu České století (2014) a kriminalisty v seriálu Život a doba soudce A. K. (2014). Lidi bavil i v pořadu Na stojáka. V politicko-satirickém seriálu Kancelář Blaník (2014) vytvořil postavu lobbisty Tondy Blaníka, kterou znovu ztvárnil i ve filmu Prezident Blaník (2018). Za roli syna Petra ve filmu Bohdana Slámy Bába z ledu (2017) byl nominován na Českého lva.
