Díky amnestii prezidenta Václava Klause v roce 2013, mu byl trest částečně zahlazen. V roce 2017 mu lékaři diagnostikovali rakovinu hrtanu. V boji proti nemoci prošel Jiří Pomeje i čtyřicetidenní hladovkou, nakonec podstoupil operaci, při které přišel o hlas.
Jiří Pomeje daboval akční hrdiny jako Jean-Claude van Damma, Arnolda Schwarzeneggera a Sylvestera Stallona. Objevil se také ve filmech Kameňák, Playgirls, Nahota na prodej. Podílel se na produkci filmů Princezna ze mlejna, Z pekla štěstí a Kameňák.
Jiří Pomeje byl třikrát ženatý. První manželkou byla herečka Michaela Kuklová. Krátce byl ženatý i se zpěvačkou Ivetou Bartošovou. Od roku 2013 byla jeho manželkou diskžokejka Andrea Pomeje, rozená Šťastná. Mají dceru Annu.