Premium

Získejte všechny články
jen za 89 Kč/měsíc

Ceny „čtení“ genů padají strmě dolů

Náklady na čtení sekvence písmen v našem genetickém kódu padají strmě k zemi. Co před deseti lety bylo za miliardy, je dnes za tisíce. Tento týden padla také jedna psychologická hranice: tisíc dolarů za důkladné "přečtení" (správně sekvenování) DNA jednoho člověka.

Vaše sekvenovací armáda je připravena. Na snímku je jedna sada strojů HiSeq X. | foto: Ilumina

Osm let a tři miliardy dolarů byly zapotřebí k tomu, aby se podařilo v rámci mezinárodního akademického projektu (a za pošťouchnutí soukromníků) přečíst první lidský genom. Nyní by se stejný výkon dal provést zhruba za den a za cenu tisíce dolarů. Tvrdí to alespoň firma Ilumina, která v těchto dnech představila nové zařízení na čtení genetického kódu (specifikace zde).

Má to samozřejmě svůj háček. Přístroj musí běžet prakticky nepřetržitě, aby se podařilo náklady udržet pod tisícovkou dolarů za kus. To pak v praxi znamená, že jedna souprava (stroje lze koupit jen v sestavách po deseti kusech) za rok přečte 18 tisíc lidských genomů. Což se asi povede málokde, a tak díky platům obsluhy a podobným nákladům budou skutečné náklady na jeden genom jistě vyšší.

Vývoj ceny za "přečtení" jednoho genomu podle společnosti Ilumina od roku 2001 až po rok 2014. Společnost se chlubí tím, že pád cen je rychlejší, než kdyby platil tzv. Mooreův zákon, o kterém většina z nás slyšela poprvé v souvislosti s vývoje tranzistorů, potažmo pak výkonu počítačů obecně.

A i kdyby se podařilo zprovoznit "čtecí fabriku" na 18 tisíc lidských genomů ročně, je otázkou, co s nimi. Takové množství údajů je obtížné uchovávat a přímo pekelné nějak rozumně zpracovat a zjistit z nich něco zajímavého. Pokrok v technologii sekvenování předběhla zbytek genetiky.

Což samozřejmě není až tak hrozné; nabízí se srovnání s IT. Nárůst produktivity práce díky počítačům také přímo nekopíroval nárůst hrubé výpočetní síly počítačů, či chcete-li tzv. Mooreův zákon. Důležitější bylo najít vhodné využití a rozvoj dalších technologií, třeba Internetu.

Jen pro lidi

Přístroj funguje zatím pouze pro lidskou DNA. Není to ovšem dané přímo technologií, ale pouze softwarově, tvrdil alespoň genetikovi Micku Watsonovi údajně nejmenovaný zdroj přímo ze společnosti Ilumina (součástí tiskové zprávy tato informace není). Teoreticky je tedy možné "hacknout" zařízení pro použití na jiné druhy. Na rozdíl od největší konkurence, zařízení Ion Proton firmy Life Technologies, která je technologicky omezena pouze na čtení lidské DNA. A které se mimochodem pohybuje v cenách nepříliš vysoko nad nově oznámeným přístrojem Iluminy.

Hranice tisíc dolarů je samozřejmě především psychologická, důležitý je ovšem pokračující trend, který symbolizuje. Genetika sice není tak všemocná, jak jsme si mysleli (nebo jí možná nerozumíme) - v genech příčiny a léky na všechny nemoci světa rozhodně nenacházíme (více zde) - ale to neznamená, že by levné genetické testy neměly smysl.

Pokud bude sekvenování skutečně levné a přesné, může představovat pro lékaře i pacienty cenné informace například při nasazení té nejlepší vhodné terapie či určení možných rizik. Levnější technologie může také postupně přinést řadu dalších využití, která se dnes zjevně nenabízí. Podle již zmíněného Watsona údajně Ilumina dostala nabídku od alespoň jedné země, aby sekvenovala "v podstatě všechny obyvatele". To je téměř jistě přehnané, i kdyby tou zemí byl Vatikán, ale naznačuje to, co by mohlo být v blízké době možné.

Technologický vývoj čtení DNA je tak rychlý, že v loňské roce došlo k ojedinělé události. Nadace tzv. X Prizes zrušila svou genetickou soutěž (Archon X Prize) s dotací 10 milionů dolarů. Ty měl dostat první tým, který dokáže dostatečně přesně přečíst za měsíc 100 lidských genomů při ceně pod 10 tisíc dolarů za kus. 

Vypsal ji v roce 2003 genetik a podnikatel Craig Venter, který prvnímu týmu chtěl dát 500 tisíc dolarů, postupně díky dalším dárcům narostla odměna do výše 10 milionů dolarů. Peníze se měly rozdělit na základě přímého klání na podzim roku 2013, ale v srpnu pořadatelé soutěž zrušili, protože její podmínky splňuje v podstatě každá laboratoř, která by si nakoupila dostatek běžně dostupných přístrojů na sekvenování DNA.

Autor:
Témata: genom
  • Nejčtenější

Zázrak! NASA po pěti měsících obdržela od sondy Voyager smysluplnou zprávu

v diskusi je 135 příspěvků

23. dubna 2024  13:37

Když se v únoru letošního roku stále nedařilo navázat smysluplnou komunikaci s jedním z...

Herečce Slávce Budínové by bylo 100 let. Zemřela opuštěná, bez zájmu veřejnosti

v diskusi je 27 příspěvků

21. dubna 2024

Před 100 lety, 21. dubna 1924, se v Ostravě narodila známá česká herečka Slávka Budínová.

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Znovuzrození japonských letadlových lodí. Ve výzbroji budou mít F-35B

v diskusi je 51 příspěvků

19. dubna 2024

Japonsko má ve své ústavě zakázáno vlastnit ofenzivní zbraně, jako jsou letadlové lodě. Doba...

Uvidíme v budoucnu na obloze druhý Měsíc? Příčinou může být neobvyklá hvězda

v diskusi je 13 příspěvků

17. dubna 2024

Velmi neobvyklá hvězda éta Carinae v 19. století náhle zjasnila a stala se druhou nejjasnější...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Unikátní exkurze. Nahlédněte do francouzské jaderné ponorky před vyplutím

v diskusi je 16 příspěvků

20. dubna 2024

Není obvyklé, aby reportéři mohli nahlédnout do jaderné ponorky v aktivní službě. Agentura AP nyní...

Jiří Horák obnovil ČSSD a dovedl ji do parlamentu. Se Zemanem si nerozuměl

v diskusi nejsou příspěvky

24. dubna 2024

Před 100 lety se narodil Jiří Horák, který po sametové revoluci pomáhal znovuobnovit sociální...

Dnes už se bez nich válčit nedá. Raketový vzestup bojových dronů

v diskusi jsou 3 příspěvky

24. dubna 2024

Bezpilotní letadla (drony) jsou v posledních dvou dekádách na raketovém vzestupu. Přispěla k tomu...

Snadno s fotkami už i ve Windows. Aplikace Fotografie vyrostla na novou úroveň

v diskusi nejsou příspěvky

24. dubna 2024

Premium Aplikace Fotografie, která je pevnou součástí Windows, slouží nejen k prohlížení obrázků. Stejně...

Zázrak! NASA po pěti měsících obdržela od sondy Voyager smysluplnou zprávu

v diskusi je 135 příspěvků

23. dubna 2024  13:37

Když se v únoru letošního roku stále nedařilo navázat smysluplnou komunikaci s jedním z...

Akční letáky
Akční letáky

Všechny akční letáky na jednom místě!

Manželé Babišovi se rozcházejí, přejí si zachovat rodinnou harmonii

Podnikatel, předseda ANO a bývalý premiér Andrej Babiš (69) s manželkou Monikou (49) v pátek oznámili, že se...

Sexy Sandra Nováková pózovala pro Playboy. Focení schválil manžel

Herečka Sandra Nováková už několikrát při natáčení dokázala, že s odhalováním nemá problém. V minulosti přitom tvrdila,...

Herečka Hunter Schaferová potvrdila románek se španělskou zpěvačkou

Americká herečka Hunter Schaferová potvrdila domněnky mnoha jejích fanoušků. A to sice, že před pěti lety opravdu...

Největší mýty o zubní hygieně, kvůli kterým si můžete zničit chrup

Možná si myslíte, že se v péči o zuby orientujete dost dobře, přesto v této oblasti stále ještě existuje spousta...

Tenistka Markéta Vondroušová se po necelých dvou letech manželství rozvádí

Sedmá hráčka světa a aktuální vítězka nejprestižnějšího turnaje světa Wimbledonu, tenistka Markéta Vondroušová (24), se...