Thomas upadl při sjezdu z Col de la Biche, prvního ze tří dnešních vrcholů, zhruba 100 km před cílem. Na zemi s Velšanem skončil také Polák Rafal Majka, jenž také utrpěl zranění, ale zatím pokračuje.
Nedlouho po nich, ale při stoupání, postihl pád také Španěla Alberta Contadora.
Jednatřicetiletý Thomas vyhrál na letošní Tour úvodní časovku v Düsseldorfu a žlutý trikot držel až do páté etapy.
Po sobotě byl v průběžném pořadí 12 sekund za krajanem a kolegou ze Sky Froomem.
Těžký pád měl letos Thomas i na Giru d’Italia, kde ho o šance na celkový úspěch připravil špatně zaparkovaný policejní motocykl.