Nejvíce se dvěma favoritům dokázali přiblížit jejich týmoví kolegové Giancarlo Fisichella a Felipe Massa, ovšem s uctivým časovým odstupem.
Stejně jako před třemi týdny v Austrálii zářil Ralf Schumacher, který zajel šestý čas, a zatím je překvapivě na jedno kolo rychlejší než týmový kolega z Toyoty Trulli.
Do první desítky se ještě vtěsnali Villeneuve z BMW, Klien z Red Bullu a Liuzzi z Toro Rosso.
Smůlu měl Juan Pablo Montoya s McLarenem, který kvůli problémům s tlakem paliva nedokončil letmé kolo, a do konce hodinovky už zůstal v garáži.
Vitantonio Liuzzi si neporadil s nástrahami přestavěné zatáčky Variante Alta, když v zúženém místě vjel na trávu a dostal smyk.
Mnohem hůře dopadl nováček Nico Rosberg, který ve výjezdu ze zatáčky Gillese Villeneuva vjel na obrubník a poslal svůj Williams do bariéry.
Třetí trénink Velké ceny San Marina F1:1. M.Schumacher Ferrari 1:23.787
2. Alonso Renault + 0.281
3. Fisichella Renault + 0.590
4. Massa Ferrari + 0.596
5. Raikkonen McLaren-Mercedes + 0.839
6. R.Schumacher Toyota + 0.880
7. Button Honda + 1.063
8. Villeneuve BMW-Sauber + 1.129
9. Klien Red Bull-Ferrari + 1.197
10. Liuzzi Toro Rosso-Cosworth + 1.207
11. Barrichello Honda + 1.254
12. Webber Williams-Cosworth + 1.418
13. Coulthard Red Bull-Ferrari + 1.788
14. Speed Toro Rosso-Cosworth + 1.875
15. Heidfeld BMW-Sauber + 1.914
16. Albers MF1-Toyota + 2.016
17. Trulli Toyota + 2.019
18. Monteiro MF1-Toyota + 2.689
19. Rosberg Williams-Cosworth + 3.232
20. Sato Super Aguri-Honda + 4.480
21. Ide Super Aguri-Honda + 5.543
22. Montoya McLaren-Mercedes bez času
