Nadpis berte s rezervou avšak příběh nového Half-Lifu patří mezi ty složitější a rozvinutější, které bez patřičného hledání informací důmyslně ukrytých ve hře nemáte šanci zcela pochopit, natožpak si zodpovědět na všechny otázky, které Vás napadnou v přůběhu hraní. Bohužel kompletního vysvětlení děje nového Half-Lifu se nedočkáte, nedozvíte se také kdo je záhadný muž s kufříkem avšak majitelé Gold verze hry, distribuované přes Steam, obsahující mimo jiné CS: Source, HL1: Source, Day of Defeat: Source a také bonusovou knížku objasňující děj, dali informace dohromady a pokusili se vytvořit časovou osu, ve které jsou přehledně znázorněny události jak prvního tak i druhého dílu. Pospojováním těchto událostí a materiálů vznikla velice povedená "fan-stránka", kde se dozvíte kdo jsou ve skutečnosti Combine, jak to bylo s vetřelci z Xenu a proč probíhala sedmi hodinová válka. Pro fanoušky této hry, je pročtení těchto textů prakticky nutnost, vy ostatní, kteří se pouze oddáváte samotné hře a děj vás nezajímá by jste se mohli také něco dozvědět.
