Poté co se hlavní hrdina, se svojí láskou Kaileenou, vrátil z Ostrova Času do Babylonu, zjistil, že místo toužebně očekávaného míru je celé království zpustošeno probíhajícími boji a celý národ se obrátil proti němu. To bylo pár slov o příběhu z nového pokračování akční hry Prince of Persia. Prince of Persia: The Two Thrones se pokouší zkombinovat to nejlepší z předešlých dvou dílů, což podle autorů celou sérii oživí a dodá jí vitalitu. V tomto díle bude přesně vyvážená dávka akrobacie a zajímavého příběhu, což by mělo oslovit fanoušky předchozích dílů, ale i naprosté nováčky. Hra se pochlubí i nepřeberným množstvím způsobů, jak likvidovat soupeře. Od speciálních komb, přes skoky ze střechy až po manipulace s časem. Nově bude zahrnuto i umění nepozorovaného pohybu a nenadálých útoků.