U nás Folding@Home běží na Acer ConceptD 500. Za necelých deset dní spočítal více než 500 pracovních úkolů. | foto: Václav Nývlt, Technet.cz

Nvidia vyzývá hráče, aby své grafické karty nechali bojovat se SARS-CoV-2

  • 94
Celkem devět projektů na platformě Folding@Home je zaměřených na poznání viru SARS-CoV-2 a vývoj účinné látky, která znemožní jeho úspěšné uchycení v hostiteli. Šest z nich přitom využívá výhradně výkon grafických čipů. Nvidia proto vyzývá hráče, aby své výkonné karty k tomuto účelu propůjčili.

Projekt Folding@Home je již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Instalací speciálního programu uživatel umožní vědcům použít výpočetní výkon jejich procesoru nebo grafické karty  – software z řídicího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola. Jednotlivé úlohy zpravidla stroji zaberou jednotky nebo desítky hodin. Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří grid projektu Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa. Za projektem stojí vědci ze Stanfordské univerzity.

Grafické uživatelské rozhraní klienta Folding@Home. Program funguje zcela samostatně, toto rozhraní uživatel otevře spíše ze zvědavosti.

Na konci února se vedení projektu rozhodlo poskytnout obří výpočetní kapacitu gridu na pomoc s poznáním viru SARS-CoV-2 a vývojem léčebné látky na COVID-19. Psali jsme o tom v článku I vy můžete pomoci nalézt lék na COVID-19, vědci potřebují všechen výkon.

V tuto chvíli již na platformě Folding@Home běží devět projektů týkajících se nového koronaviru a očekává se, že se zvyšujícím se počtem testů výrazně narostou i objemy dat, která je nutné zpracovat. Významný výrobce výkonných grafických karet, společnost Nvidia, proto na twitteru vyzval hráče, aby do výpočetního gridu své grafické karty zapojili.   

Firma samozřejmě nechce, aby se lidé vzdali hraní her, ale aby grafické karty nenechali zahálet v době, kdy jejich výkon ke hře nepotřebují.

Ke gridu se přidáte nainstalováním klienta folding@home z tohoto odkazu, založením vlastní identity, případně týmu, nebo přidáním se k existujícímu týmu. Pokud by se někdo chtěl přidat k nám - tým TechnetCZ, číslo 236157, je vítán.

V tuto chvíli běží devět projektů souvisejících s COVID-19. Nemusíte je vybírat, stačí nechat volbu na „any projects“, ty týkající se koronaviru mají automaticky prioritu a budou tedy zařazovány přednostně. Projekty začínající číslem 14 jsou určené pro procesory CPU, ty s číslem 11 počítají grafické karty.

Aktuálně běžící projekty

14530/14531 Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target

14328 - Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target

11741: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2.

11746: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741).

11742: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor.

11743: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease – potential drug target.

11744: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody.

11745: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody.

Do boje s koronavirem v rámci gridu Folding@Home je zapojeno velké množství strojů, přidaly se totiž i některé firmy s grafickými čipy ve svých cloudových centrech. V noci ze soboty na neděli tak dokonce přestaly stíhat servery na rozdělování práce, nicméně již byly posíleny a v následujících hodinách by mělo vše standardně fungovat (práce pro GPU nám byla v  přidělena, CPU na práci čeká, nejsou dostupné některé statistiky - nic z toho ale nemusíte hlídat a řešit). Vědci stále generují nové datasety a tak se toho, že by vaše grafická karta zahálela, nemusíte bát.

Folding@Home na Acer ConceptD 500

U nás stále běží výkonný desktop Acer ConceptD 500 s procesorem Intel Core i9-9900K, 32 GB operační paměti, grafickou kartou Nvidia Quadro RTX 4000, 1TB SSD a 2TB HDD. Projektu jsme nechali všechen dostupný výkon. Podle chytré zásuvky TP-Link HS110, do které je zapojen, za necelých deset dní spotřeboval 52 kWh elektrické energie.