Pátek 22. ledna 2021, svátek má Slavomír
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Pátek 22. ledna 2021 Slavomír

I vy můžete pomoci nalézt lék na COVID-19, rozšiřte tým TechnetCZ

  11:04aktualizováno  20. března 18:34
Cílem léku na nemoc COVID-19 je zabránit viru uchytit se na plicní buňce. Vědci proto potřebují nasimulovat způsoby, jakými protein vazbu vytvoří. Projekt Folding@Home vědcům nabídl výpočetní výkon na své platformě tvořené obrovským množstvím domácích počítačů. Zapojit můžete i ten svůj.

Projekt Folding@Home nyní pomáhá i s vývojem léku na COVID-19. U nás běží na Acer ConceptD 500 s Intel Core i9 a Nvidia Quatro RTX. | foto: screenshot Václav Nývlt - Technet.cz

Aktualizace 20. 3. 2020 v 18:30 - Děkujeme všem, kteří se připojili k týmu TechnetCZ (číslo: 236157), společně naše grafické karty a procesory ke dni aktualizace spočítaly 5 617 pracovních úkolů a za posledních pět dní jsme se z týmu 3 076. v pořadí stali týmem 1 356. v celosvětovém pořadí. Díky, jste skvělí! Jedeme dál, kdo má slušný hardware a chuť pomoci, přidejte se.

Tým TechnetCZ 20.3.20120

Acer ConceptD 500 s Core i9-9900K a Quadro RTX 4000 je samozřejmě stále v provozu.

Původní text: 

Největší potíže koronavirus způsobí ve chvíli, kdy se dostane do plic. Účinný lék by tak měl zabránit virovému proteinu uchytit se na hostitelské plicní buňce. Virus však není statický objekt, naopak je v neustálém velmi neuspořádaném pohybu a s tím se mění i tvar proteinu. Vědci proto potřebují nasimulovat obrovské množství variant vazby proteinu na receptor, aby mohli optimalizovat účinnou látku vznikajícího léku. Víc a podrobněji se o tom dočtete na stránce projektu zde (v angličtině).

Stanfordská univerzita proto vědcům nabídla výpočetní výkon svého projektu Folding@Home, který je využíván vývojovými týmy pro výpočty a simulace při výzkumu léčebných látek na léčbu rakoviny, Alzheimerovy, Parkinsonovy a Huntingtonovy choroby. Projekt tak nyní bude sloužit i pro výzkum viru SARS-CoV-2.

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně...

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně „spikes protein“), kterými se virus snaží uchytit na hostitelské buňce v plicích. Aby lékaři našli látku, která účinně znemožní jejich funkci, musí je co nejlépe poznat.

Projekt Folding@Home je známý a již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Ty pomocí speciálního softwaru nabízí uživatelem právě nevyužívaný výpočetní výkon – software z řídícího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola. Jednotlivé úlohy zpravidla stroji zaberou jednotky nebo desítky hodin. Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří grid projektu Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa.

Uživatel si může nastavit, kolik výkonu dá gridu k dispozici během běžného provozu, nebo zda dá výkon k dispozici jen v době, kdy u počítače nesedí (počítač nic nedělá) a výkon tak nepotřebuje.

Vyšší nebo vysoké zatížení počítače se pro uživatele projeví zvýšenou spotřebou elektrické energie a v závislosti na konstrukci počítače i hlučností.

My jsme projekt Folding@Home (ke stažení zde) nainstalovali na výkonný desktop Acer ConceptD 500 s procesorem Intel Core i9-9900K, 32 GB operační paměti, grafickou kartou Nvidia Quadro RTX 4000, 1TB SSD a 2TB HDD. Projektu jsme zatím nechali všechen dostupný výkon, podle aplikace HW Info je běžně využito 100 % výkonu procesoru a zhruba 80 % výkonu grafického čipu – i ten je u Folding@Home do výpočtů zapojen.

Folding@Home na Acer ConceptD 500

Folding@Home na Acer ConceptD 500. Počítač nás potěšil hlučností – i při dlouhodobé zátěži je hluk ventilace poměrně nízký.

Spotřebu energie měříme pomocí chytré zásuvky HS110 od TP-Linku (na obrázku vpravo) spotřeba vytíženého stroje se pohybuje kolem 240 W, plus minus dva watty. Za den tak plně vytížený ConceptD 500 spotřebuje zhruba 5,8 kWh elektrické energie, což je při běžné domácí sazbě zhruba 29 korun. Samozřejmě záleží na spotřebě daného počítače a nastavení výkonu, nakolik smí Folding@Home počítač vytížit.

„Něco dělat“ pro zlepšení situace je vždy lepší než bohapustě panikařit. Většina z nás nemá ani vzdělání, ani schopnosti ve vývoji léku vědcům pomoci, věnováním výpočetního výkonu však můžete jasně přispět. A když zrovna ne proti koronaviru, tak proti dalším nebezpečným nemocem.

Aktualizace - Článek původně obsahoval chybnou informaci, že Folding@Home využívá platformu BOINC. F@H jako klient pro BOINC byl sice kdysi vytvořen a testován, nakonec se ale projekt vydal vlastní cestou.

  • Nejčtenější

Android TV mizí z televizorů. Podívejte se, co jej letos mnohde nahradí

Operačnímu systému Android TV zřejmě začíná poslední sezóna. Jak se ukázalo na veletrhu CES 2021, již letošní novinky...

Válka v jednom čísle. Jak Sověti na papíře vyhráli nad Západem

Sověti vyvinuli na přelomu 60. a 70. let analytickou metodu, která měla umožnit snadné srovnání vojenské techniky...

Čest, talent i služba Hitlerovi. Nejlepší tankista války byl z Jesenicka

Během druhé světové války vznikla po vzoru leteckých es nová kasta es tankových. Patrně nejlepším tankistou 2. světové...

Rezervace očkování je plná zbytečných chyb. Způsobila i pád celého systému

Státní web na rezervaci očkování proti covidu-19 byl plný úplně základních chyb a zbytečných komplikací. Navíc začal...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Operaci Pouštní bouře zahájily vrtulníky US Army úderem na radary

První letecký úder proti Iráku neprovedly před třiceti lety „neviditelné bombardéry“ USAF, ale vrtulníky Apache US...

Kdo staví vilu na Babě? Muž s vazbami na sponzory Zemanovy kampaně

Premium Nová prosklená vila na vrchu Baba v Praze budí zájem místních i turistů. Dům patří firmě Luboše Paška, který je...

Ano, Češi byli nejlepší! říká zámořský expert o časech, kdy i Kanada žárlila

Premium Omlouvá se při vzpomínce na nezdar Pavla Patery v Dallasu. Zápasy proti Buffalu s Dominikem Haškem v brance přirovnává...

TEST olejů: nejhorší je kokosový, zdravější je i sádlo

Premium Na smažení a fritování, do salátů, omáček i dresinků... Do velkého srovnání olejů a tuků jsme vybrali dvacet výrobků....

  • Další z rubriky

Aktivujte si vyšší level ochranného štítu Windows

Prozkoumejte s námi užitečná a méně známá nastavení antiviru a firewallu Microsoft Defender. Objevíte funkce, které...

Deset věcí, které byste měli udělat při prvním spuštění PC

Možná i vy jste letos dostali nový notebook či stolní PC s Windows. Následující kroky v nastavení dokáže provést každý...

Nejlepší dárek na poslední chvíli: Zabezpečte blízkým počítač, i na dálku

Je pomalu za pět minut dvanáct a vy ještě na poslední chvíli potřebujete sehnat užitečný dárek? Věnujte svým blízkým...

První počítačový vir byl jen zkouška. Škodit začaly přesně před 35 lety

Historie počítačových virů je relativně mladá. I přesto tyto programové kódy už v celosvětovém měřítku způsobily...

Vytetovaná sexuální instrukce zaráží i mého gynekologa, líčila dívka

Nesedí k ní, ale onen vulgární sexuální povel má na podbřišku opravdu vytetovaný. Vznikl jako rozpustilá, hrdá,...

Analytik: Evropa byla od blackoutu setiny. Bez ČR by to Rakousko nezvládlo

8. leden 2021 se mohl stát skutečným „černým dnem”. Evropě totiž hrozil blackout, tedy masivní výpadek dodávek...

Dalibor Janda leží ve vážném stavu v nemocnici na koronární jednotce

Dalibor Janda (67) byl hospitalizován v pražské Fakultní nemocnici Královské Vinohrady. Zpěvák leží ve vážném stavu na...

Bezplatné jezdění po dálnici? Elektronické známky téměř nikdo nehlídá

Premium Druhý týden platí na českých dálnicích novinka v­ podobě elektronické dálniční známky. Zatímco lidé takzvané viněty...

Hráč vytvořil v Minecraftu Everest v měřítku 1:1, na vrchol lezl čtyři hodiny

S využitím skutečných geografických dat vytvořil streamer G0ularte virtuální kopii nejvyšší hory na Zemi a poté vylezl...