Neděle 9. srpna 2020, svátek má Roman
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Neděle 9. srpna 2020 Roman

I vy můžete pomoci nalézt lék na COVID-19, rozšiřte tým TechnetCZ

  11:04aktualizováno  20. března 18:34
Cílem léku na nemoc COVID-19 je zabránit viru uchytit se na plicní buňce. Vědci proto potřebují nasimulovat způsoby, jakými protein vazbu vytvoří. Projekt Folding@Home vědcům nabídl výpočetní výkon na své platformě tvořené obrovským množstvím domácích počítačů. Zapojit můžete i ten svůj.

Projekt Folding@Home nyní pomáhá i s vývojem léku na COVID-19. U nás běží na Acer ConceptD 500 s Intel Core i9 a Nvidia Quatro RTX. | foto: screenshot Václav Nývlt - Technet.cz

Aktualizace 20. 3. 2020 v 18:30 - Děkujeme všem, kteří se připojili k týmu TechnetCZ (číslo: 236157), společně naše grafické karty a procesory ke dni aktualizace spočítaly 5 617 pracovních úkolů a za posledních pět dní jsme se z týmu 3 076. v pořadí stali týmem 1 356. v celosvětovém pořadí. Díky, jste skvělí! Jedeme dál, kdo má slušný hardware a chuť pomoci, přidejte se.

Tým TechnetCZ 20.3.20120

Acer ConceptD 500 s Core i9-9900K a Quadro RTX 4000 je samozřejmě stále v provozu.

Původní text: 

Největší potíže koronavirus způsobí ve chvíli, kdy se dostane do plic. Účinný lék by tak měl zabránit virovému proteinu uchytit se na hostitelské plicní buňce. Virus však není statický objekt, naopak je v neustálém velmi neuspořádaném pohybu a s tím se mění i tvar proteinu. Vědci proto potřebují nasimulovat obrovské množství variant vazby proteinu na receptor, aby mohli optimalizovat účinnou látku vznikajícího léku. Víc a podrobněji se o tom dočtete na stránce projektu zde (v angličtině).

Stanfordská univerzita proto vědcům nabídla výpočetní výkon svého projektu Folding@Home, který je využíván vývojovými týmy pro výpočty a simulace při výzkumu léčebných látek na léčbu rakoviny, Alzheimerovy, Parkinsonovy a Huntingtonovy choroby. Projekt tak nyní bude sloužit i pro výzkum viru SARS-CoV-2.

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně...

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně „spikes protein“), kterými se virus snaží uchytit na hostitelské buňce v plicích. Aby lékaři našli látku, která účinně znemožní jejich funkci, musí je co nejlépe poznat.

Projekt Folding@Home je známý a již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Ty pomocí speciálního softwaru nabízí uživatelem právě nevyužívaný výpočetní výkon – software z řídícího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola. Jednotlivé úlohy zpravidla stroji zaberou jednotky nebo desítky hodin. Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří grid projektu Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa.

Uživatel si může nastavit, kolik výkonu dá gridu k dispozici během běžného provozu, nebo zda dá výkon k dispozici jen v době, kdy u počítače nesedí (počítač nic nedělá) a výkon tak nepotřebuje.

Vyšší nebo vysoké zatížení počítače se pro uživatele projeví zvýšenou spotřebou elektrické energie a v závislosti na konstrukci počítače i hlučností.

My jsme projekt Folding@Home (ke stažení zde) nainstalovali na výkonný desktop Acer ConceptD 500 s procesorem Intel Core i9-9900K, 32 GB operační paměti, grafickou kartou Nvidia Quadro RTX 4000, 1TB SSD a 2TB HDD. Projektu jsme zatím nechali všechen dostupný výkon, podle aplikace HW Info je běžně využito 100 % výkonu procesoru a zhruba 80 % výkonu grafického čipu – i ten je u Folding@Home do výpočtů zapojen.

Folding@Home na Acer ConceptD 500

Folding@Home na Acer ConceptD 500. Počítač nás potěšil hlučností – i při dlouhodobé zátěži je hluk ventilace poměrně nízký.

Spotřebu energie měříme pomocí chytré zásuvky HS110 od TP-Linku (na obrázku vpravo) spotřeba vytíženého stroje se pohybuje kolem 240 W, plus minus dva watty. Za den tak plně vytížený ConceptD 500 spotřebuje zhruba 5,8 kWh elektrické energie, což je při běžné domácí sazbě zhruba 29 korun. Samozřejmě záleží na spotřebě daného počítače a nastavení výkonu, nakolik smí Folding@Home počítač vytížit.

„Něco dělat“ pro zlepšení situace je vždy lepší než bohapustě panikařit. Většina z nás nemá ani vzdělání, ani schopnosti ve vývoji léku vědcům pomoci, věnováním výpočetního výkonu však můžete jasně přispět. A když zrovna ne proti koronaviru, tak proti dalším nebezpečným nemocem.

Aktualizace - Článek původně obsahoval chybnou informaci, že Folding@Home využívá platformu BOINC. F@H jako klient pro BOINC byl sice kdysi vytvořen a testován, nakonec se ale projekt vydal vlastní cestou.

Přechod na DVB-T2

Od 27. 11. probíhá postupný přechod na vysílací standard DVB-T2. Kvůli koronavirové pandemii vláda rozhodla o odložení zbývajících přechodů na vysílání DVB-T2. Diváci si tak musí pořídit televizi s podporou kódování H.265 (HEVC) nebo starší televizi doplnit vhodným set-top boxem.

  • Nejčtenější

Díky, že létáte se SpaceX. Loď Crew Dragon úspěšně dopadla do moře

Američtí astronauti Robert Behnken a Douglas Hurley úspěšně absolvovali nedělní návrat z Mezinárodní vesmírné stanice...

I Jižní Korea měla své Techtle Mechtle, poradila si jinak než Česko

Jak vypadá vyšetřování velkého ohniska kolem nočního klubu v zemi, kde „chytrá karanténa“ opravdu funguje. Jižní Korea...

Svět je čím dál zelenější. Česko v současnosti míří opačným směrem

Na planetě Zemi v posledních desetiletích přibývá zeleně. Neplatí to však pro všechny státy. Česko bohužel představuje...

Dusičnan amonný zabíjel mnohokrát. Ovšem mnohem více životů zachránil

Výbuch v Bejrútu nebyl ani zdaleka jediným případem, kdy dusičnan amonný způsobil katastrofu. Některé z nich byly...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Televizory LG se mohou přehřívat, zkontrolujte, zda to není ten váš

U některých televizorů společnosti LG hrozí přetížení napájecího modulu, které může vést k jeho silnému přehřívání,...

Biolog Komárek: Jsme účastníky největšího sociologického experimentu všech dob

Premium Měsíce trvající pandemie nám převrátila životy naruby. Známý biolog, filozof a autor dvou desítek odborných knih a tří...

Brzy dospěju do bodu, kdy si účet na Facebooku zruším, říká Lucie Výborná

Premium „Je to hra. Hra, která by měla být přínosná, užitečná, inspirativní,“ říká o své práci moderátorka Českého rozhlasu...

Proč koronavirus už téměř nezabíjí. Vytratí se, nebo se vrátí ještě silnější?

Premium Koronavirus je záhadný. Nečitelný. I když ho zkoumají ti nejchytřejší lidé, pořád o něm víme málo. Chová se jinak. Je...

  • Další z rubriky

Triky pro Windows: tmavý vzhled prohlížeče Edge nebo nastavte, co se spustí

Přizpůsobit si vzhled Edge nebo nových karet je užitečné a zpříjemní vám to práci s tímto novým browserem. Podíváme se...

Na rok z domova. Google a Facebook uzavřely kanceláře. A co české firmy?

Velké technologické firmy nechávají zavřené kanceláře, nebo je pootevírají jen maličko, většina zaměstnanců tak stále...

Tipy na aplikace: Bleskurychlý přenos souborů nebo přehrávač podcastů

Mezi šikovnými aplikacemi pro mobily a tablety tentokrát najdete například dobře vybavený hudební přehrávač. Dále...

Tipy pro Windows 10: vytáhněte z Edge maximum, proměňte web v aplikaci

Změňte úložiště pro stahované soubory v browseru Edge, nastavte kontrolu pravopisu nebo případně propojte, a tak...

Ze života: Rakovina prsu může bolet nejen v pozdním stádiu
Ze života: Rakovina prsu může bolet nejen v pozdním stádiu

Ráda bych s vámi sdílela svůj příběh o tom, že rakovina bolet může. A doufám, že to alespoň jedné váhající může pomoct s rozhodováním, jestli jít...

Škoda dostane šéfa s úkolem zabránit, aby značka dotírala na VW a Audi

„Není nám k ničemu, když se Škoda vyvíjí ke třetí prémiové značce v rámci koncernu,“ prohlásil v rozhovoru publikovaném...

Krejčířovu vilu opět nikdo nechce. Už ani za dvacetinu pořizovací ceny

Ani další pokus o vydražení vily v Černošicích, která patřila odsouzenému Radovanu Krejčířovi, nebyl úspěšný. Do dražby...

Jaromír Jágr poprvé ukázal na sociálních sítích novou přítelkyni

Hokejista Jaromír Jágr (48) a modelka Dominika Branišová (26) už několik týdnů tvoří pár. Absolvovali spolu několik...

Zemřela manželka Jiřího Krampola, měla dlouhodobé zdravotní problémy

Ve věku 59 let zemřela Hana Krampolová, manželka herce Jiřího Krampola. Dlouhodobě se potýkala se zdravotními problémy.

Šéf Pirátů Ivan Bartoš je tatínkem. Miminku dali s manželkou neobvyklé jméno

Předsedovi Pirátů Ivanu Bartošovi (40) a jeho ženě Lydii (37) se v úterý večer narodil syn. Novopečený tatínek se s...