Úterý 2. března 2021, svátek má Anežka
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Úterý 2. března 2021 Anežka

I vy můžete pomoci nalézt lék na COVID-19, rozšiřte tým TechnetCZ

  11:04aktualizováno  20. března 18:34
Cílem léku na nemoc COVID-19 je zabránit viru uchytit se na plicní buňce. Vědci proto potřebují nasimulovat způsoby, jakými protein vazbu vytvoří. Projekt Folding@Home vědcům nabídl výpočetní výkon na své platformě tvořené obrovským množstvím domácích počítačů. Zapojit můžete i ten svůj.

Projekt Folding@Home nyní pomáhá i s vývojem léku na COVID-19. U nás běží na Acer ConceptD 500 s Intel Core i9 a Nvidia Quatro RTX. | foto: screenshot Václav Nývlt - Technet.cz

Aktualizace 20. 3. 2020 v 18:30 - Děkujeme všem, kteří se připojili k týmu TechnetCZ (číslo: 236157), společně naše grafické karty a procesory ke dni aktualizace spočítaly 5 617 pracovních úkolů a za posledních pět dní jsme se z týmu 3 076. v pořadí stali týmem 1 356. v celosvětovém pořadí. Díky, jste skvělí! Jedeme dál, kdo má slušný hardware a chuť pomoci, přidejte se.

Tým TechnetCZ 20.3.20120

Acer ConceptD 500 s Core i9-9900K a Quadro RTX 4000 je samozřejmě stále v provozu.

Původní text: 

Největší potíže koronavirus způsobí ve chvíli, kdy se dostane do plic. Účinný lék by tak měl zabránit virovému proteinu uchytit se na hostitelské plicní buňce. Virus však není statický objekt, naopak je v neustálém velmi neuspořádaném pohybu a s tím se mění i tvar proteinu. Vědci proto potřebují nasimulovat obrovské množství variant vazby proteinu na receptor, aby mohli optimalizovat účinnou látku vznikajícího léku. Víc a podrobněji se o tom dočtete na stránce projektu zde (v angličtině).

Stanfordská univerzita proto vědcům nabídla výpočetní výkon svého projektu Folding@Home, který je využíván vývojovými týmy pro výpočty a simulace při výzkumu léčebných látek na léčbu rakoviny, Alzheimerovy, Parkinsonovy a Huntingtonovy choroby. Projekt tak nyní bude sloužit i pro výzkum viru SARS-CoV-2.

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně...

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně „spikes protein“), kterými se virus snaží uchytit na hostitelské buňce v plicích. Aby lékaři našli látku, která účinně znemožní jejich funkci, musí je co nejlépe poznat.

Projekt Folding@Home je známý a již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Ty pomocí speciálního softwaru nabízí uživatelem právě nevyužívaný výpočetní výkon – software z řídícího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola. Jednotlivé úlohy zpravidla stroji zaberou jednotky nebo desítky hodin. Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří grid projektu Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa.

Uživatel si může nastavit, kolik výkonu dá gridu k dispozici během běžného provozu, nebo zda dá výkon k dispozici jen v době, kdy u počítače nesedí (počítač nic nedělá) a výkon tak nepotřebuje.

Vyšší nebo vysoké zatížení počítače se pro uživatele projeví zvýšenou spotřebou elektrické energie a v závislosti na konstrukci počítače i hlučností.

My jsme projekt Folding@Home (ke stažení zde) nainstalovali na výkonný desktop Acer ConceptD 500 s procesorem Intel Core i9-9900K, 32 GB operační paměti, grafickou kartou Nvidia Quadro RTX 4000, 1TB SSD a 2TB HDD. Projektu jsme zatím nechali všechen dostupný výkon, podle aplikace HW Info je běžně využito 100 % výkonu procesoru a zhruba 80 % výkonu grafického čipu – i ten je u Folding@Home do výpočtů zapojen.

Folding@Home na Acer ConceptD 500

Folding@Home na Acer ConceptD 500. Počítač nás potěšil hlučností – i při dlouhodobé zátěži je hluk ventilace poměrně nízký.

Spotřebu energie měříme pomocí chytré zásuvky HS110 od TP-Linku (na obrázku vpravo) spotřeba vytíženého stroje se pohybuje kolem 240 W, plus minus dva watty. Za den tak plně vytížený ConceptD 500 spotřebuje zhruba 5,8 kWh elektrické energie, což je při běžné domácí sazbě zhruba 29 korun. Samozřejmě záleží na spotřebě daného počítače a nastavení výkonu, nakolik smí Folding@Home počítač vytížit.

„Něco dělat“ pro zlepšení situace je vždy lepší než bohapustě panikařit. Většina z nás nemá ani vzdělání, ani schopnosti ve vývoji léku vědcům pomoci, věnováním výpočetního výkonu však můžete jasně přispět. A když zrovna ne proti koronaviru, tak proti dalším nebezpečným nemocem.

Aktualizace - Článek původně obsahoval chybnou informaci, že Folding@Home využívá platformu BOINC. F@H jako klient pro BOINC byl sice kdysi vytvořen a testován, nakonec se ale projekt vydal vlastní cestou.

  • Nejčtenější

ANALÝZA: Lidé nejsou méně ukáznění. Proč rostou počty případů a co dál

Ze současné situace neexistuje žádné jednoduché a levné východisko. Ale jedna cesta nabízí naději na relativně rychlé...

Česko bude raketová velmoc. Ale jen v tom špatném smyslu

Česká armáda se chystá na nákup nové generace protiletadlových raketových systémů. Ale je poněkud nepochopitelné, že si...

Otevřel se padák a sonda dosedla. NASA zveřejnila záběry přistání na Marsu

NASA zveřejnila tříminutový videozáznam čtvrtečního přistání robotické sondy Perseverance na povrchu Marsu. Jde o...

Nadějná data. Stále přibývá dokladů toho, že vakcíny brání šíření viru

Nadějné výsledky z posledních dní naznačují, že minimálně některé vakcíny proti viru SARS-CoV-2 výrazně zpomalují jeho...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Sahá se do rezerv. Kolik volných lůžek zbývá na českých JIPkách?

Údaje z českých nemocnic ukazují, že problém s nedostatkem lůžek intenzivní péče je nejhorší za celou dobu pandemie....

Randění pod rouškou. Reportérka absolvovala sedm pokusů o seznámení

Premium „Jestli si někoho nenajdeš, než ti bude třicet, nainstaluju ti seznamku,“ oznámila mi moje nejlepší kamarádka. Patřím...

Zavřené nezavřené restaurace. Jak vypadá zapovězený společenský život?

Premium Zaplněné stoly, skupinky lidí se sklenicemi vína a smích nesoucí se až na ulici. Nejde o výjev starý víc než rok, ale o...

Mord v hospodě U Dvou koček. Zloději odnesli cigarety, víno a ruce oběti

Premium Okolo pouličních lamp tančily roje vloček. Sníh propůjčil pražským ulicím něžný a romantický vzhled. Jen jediné...

  • Další z rubriky

Jděte s dobou a nastavte si tmavý režim i hlavní panel ve Windows

Video na pracovní ploše jako tapeta, tmavý režim šetřící oči, aktivovaná funkce nočního světla a hlavní panel na levé...

Zrychlete PC přechodem na SSD, a to i bez přeinstalace Windows

Starší nebo levnější notebooky můžete zrychlit upgradem na rychlý SSD disk. Zmenší se i energetická náročnost a...

Získejte zpět místo na discích ve Windows 10

Když dochází diskovému úložišti v počítači místo, nastává správný čas to řešit. Přinášíme devět praktických a...

Microsoft chce vrátit Windows 10 na výsluní, připravuje další vylepšení

Aktualizace uživatelského rozhraní, vizuální omlazení, nové funkce, dynamický obsah a modernější operační systém. Toho...

Gabriela Koukalová: Exmanžel mě podváděl a myslím, že utrácel mé peníze

Bývalá světová šampionka v biatlonu, dnes moderátorka televizního pořadu Showtime, Gabriela Koukalová přiznává v...

Gabriela Koukalová se pochlubila, že čeká miminko. Změnila si i příjmení

Bývalá biatlonistka Gabriela Koukalová (31) bude maminkou. V ranním vysílání na Primě se pochlubila šťastnou novinou a...

Zemřel český DJ Thomas Coastline. Bylo mu 35 let

Zemřel známý český DJ Thomas Coastline, vlastním jménem Tomáš Malina. V minulosti prodělal rakovinu tlustého střeva. O...

Chci kratší pracovní týden a pět týdnů dovolené, říká Maláčová

Válka o kurzarbeit dospěla do fáze podepisování podmínek mírové dohody. Alespoň to tak působí z úst ministryně práce a...

ANALÝZA: Lidé nejsou méně ukáznění. Proč rostou počty případů a co dál

Ze současné situace neexistuje žádné jednoduché a levné východisko. Ale jedna cesta nabízí naději na relativně rychlé...