Pondělí 17. května 2021, svátek má Aneta
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Pondělí 17. května 2021 Aneta

I vy můžete pomoci nalézt lék na COVID-19, rozšiřte tým TechnetCZ

  11:04aktualizováno  20. března 18:34
Cílem léku na nemoc COVID-19 je zabránit viru uchytit se na plicní buňce. Vědci proto potřebují nasimulovat způsoby, jakými protein vazbu vytvoří. Projekt Folding@Home vědcům nabídl výpočetní výkon na své platformě tvořené obrovským množstvím domácích počítačů. Zapojit můžete i ten svůj.

Projekt Folding@Home nyní pomáhá i s vývojem léku na COVID-19. U nás běží na Acer ConceptD 500 s Intel Core i9 a Nvidia Quatro RTX. | foto: screenshot Václav Nývlt - Technet.cz

Aktualizace 20. 3. 2020 v 18:30 - Děkujeme všem, kteří se připojili k týmu TechnetCZ (číslo: 236157), společně naše grafické karty a procesory ke dni aktualizace spočítaly 5 617 pracovních úkolů a za posledních pět dní jsme se z týmu 3 076. v pořadí stali týmem 1 356. v celosvětovém pořadí. Díky, jste skvělí! Jedeme dál, kdo má slušný hardware a chuť pomoci, přidejte se.

Tým TechnetCZ 20.3.20120

Acer ConceptD 500 s Core i9-9900K a Quadro RTX 4000 je samozřejmě stále v provozu.

Původní text: 

Největší potíže koronavirus způsobí ve chvíli, kdy se dostane do plic. Účinný lék by tak měl zabránit virovému proteinu uchytit se na hostitelské plicní buňce. Virus však není statický objekt, naopak je v neustálém velmi neuspořádaném pohybu a s tím se mění i tvar proteinu. Vědci proto potřebují nasimulovat obrovské množství variant vazby proteinu na receptor, aby mohli optimalizovat účinnou látku vznikajícího léku. Víc a podrobněji se o tom dočtete na stránce projektu zde (v angličtině).

Stanfordská univerzita proto vědcům nabídla výpočetní výkon svého projektu Folding@Home, který je využíván vývojovými týmy pro výpočty a simulace při výzkumu léčebných látek na léčbu rakoviny, Alzheimerovy, Parkinsonovy a Huntingtonovy choroby. Projekt tak nyní bude sloužit i pro výzkum viru SARS-CoV-2.

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně...

Koronavirus SARS-CoV-2 – to červené jsou právě proteinová „chňapátka“ (odborně „spikes protein“), kterými se virus snaží uchytit na hostitelské buňce v plicích. Aby lékaři našli látku, která účinně znemožní jejich funkci, musí je co nejlépe poznat.

Projekt Folding@Home je známý a již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Ty pomocí speciálního softwaru nabízí uživatelem právě nevyužívaný výpočetní výkon – software z řídícího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola. Jednotlivé úlohy zpravidla stroji zaberou jednotky nebo desítky hodin. Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří grid projektu Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa.

Uživatel si může nastavit, kolik výkonu dá gridu k dispozici během běžného provozu, nebo zda dá výkon k dispozici jen v době, kdy u počítače nesedí (počítač nic nedělá) a výkon tak nepotřebuje.

Vyšší nebo vysoké zatížení počítače se pro uživatele projeví zvýšenou spotřebou elektrické energie a v závislosti na konstrukci počítače i hlučností.

My jsme projekt Folding@Home (ke stažení zde) nainstalovali na výkonný desktop Acer ConceptD 500 s procesorem Intel Core i9-9900K, 32 GB operační paměti, grafickou kartou Nvidia Quadro RTX 4000, 1TB SSD a 2TB HDD. Projektu jsme zatím nechali všechen dostupný výkon, podle aplikace HW Info je běžně využito 100 % výkonu procesoru a zhruba 80 % výkonu grafického čipu – i ten je u Folding@Home do výpočtů zapojen.

Folding@Home na Acer ConceptD 500

Folding@Home na Acer ConceptD 500. Počítač nás potěšil hlučností – i při dlouhodobé zátěži je hluk ventilace poměrně nízký.

Spotřebu energie měříme pomocí chytré zásuvky HS110 od TP-Linku (na obrázku vpravo) spotřeba vytíženého stroje se pohybuje kolem 240 W, plus minus dva watty. Za den tak plně vytížený ConceptD 500 spotřebuje zhruba 5,8 kWh elektrické energie, což je při běžné domácí sazbě zhruba 29 korun. Samozřejmě záleží na spotřebě daného počítače a nastavení výkonu, nakolik smí Folding@Home počítač vytížit.

„Něco dělat“ pro zlepšení situace je vždy lepší než bohapustě panikařit. Většina z nás nemá ani vzdělání, ani schopnosti ve vývoji léku vědcům pomoci, věnováním výpočetního výkonu však můžete jasně přispět. A když zrovna ne proti koronaviru, tak proti dalším nebezpečným nemocem.

Aktualizace - Článek původně obsahoval chybnou informaci, že Folding@Home využívá platformu BOINC. F@H jako klient pro BOINC byl sice kdysi vytvořen a testován, nakonec se ale projekt vydal vlastní cestou.

Fagradalsfjall online

Sledujte živě aktivní sopku na Islandu. Erupce začala po týdnech otřesů 19. března a zláště pak v noci nabízí fascinující podívanou.

  • Nejčtenější

Jak dopadne pandemie covidu? Zřejmě nejhůře jak mohla, přitom ne špatně

Virus SARS-CoV-2 napříč světem zřejmě zdomácní. Pravděpodobnost, že by se ho podařilo vytlačit a získat proti němu...

Co může Rusko nabídnout Česku jako nástupce gripenů a proč se tak nestane

Česko připravuje výběrové řízení na nové nadzvukové letouny, protože za šest let vyprší smlouva na pronájem JAS 39...

Číně se jako druhému státu světa podařilo úspěšně přistát na Marsu

Čína jako druhý stát světa po USA úspěšně přistála na planetě Mars. Zvládla to přitom na první pokus. Pojízdná...

Bez panzerfaustů by to měli pražští povstalci mnohem těžší

Nenahraditelnou zbraní Pražského povstání se stala pancéřová pěst. Bez této účinné pěchotní protitankové zbraně by byl...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Fanoušci retra pláčou. Z Windows zmizí ikonka CRT monitoru, změní se i koš

Na podzim plánuje Microsoft vydat novou podzimní edici Windows 10, která přinese další pokračování přechodu na nový...

Zapomenutý Čech třikrát přelstil gestapo. Francouzi mu dali válečný kříž

Premium Za války byl jedním z nejaktivnějších členů československého odboje ve Francii. Převáděl lidi přes hranici, z ilegality...

Nejsme Slované ani Germáni. Češi mají unikátní mix genetických profilů

Premium Čemu vlastně Slované věřili? Byli skutečně beránci? Či si libovali v krvavých rituálech a bojích jako Germáni? Čeho se...

Tisknu se k zemi. A rakety se blíží! Reportérka pod sprchou raket Hamasu

Premium Ležím na trávníku, příjemně teplý večer. Byla by to pohoda, ale je to peklo, místo hvězd totiž počítám na nebi zásahy...

  • Další z rubriky

Vyzkoušejte všechny triky, které nabízí Centrum akcí ve Windows 10

Oznámení informací a Centrum akcí Windows 10 jsou dvě funkce, které podávají přehled o stavu operačního systému a...

Tyto aplikace vás sledují na každém kroku

Více než polovina ze stovky nejlepších aplikací figurujících v žebříčku obchodu Apple využívá pro svůj prospěch nebo...

Deset lišáckých věcí, které můžete dělat ve Firefoxu a nevěděli jste to

Firefox příští rok oslaví 20. výročí. Mezi webovými prohlížeči jde o pojem. Během své existence přišel s celou řadou...

Poznejte méně známé funkce Chromu včetně tlačítka, které byste měli použít

Internetový prohlížeč Google Chrome obsahuje spoustu skrytých funkcí a malých triků, o kterých možná nevíte. Přinášíme...

Bohuš Matuš se oženil v Krtkově světě. Vzal si o 30 let mladší Lucii

Bohuš Matuš (47) a Lucie Palkaninová (18) jsou manželé. Vzali se ve středu odpoledne v rodinném parku Krtkův svět v...

Televize NBC odmítá vysílat Zlaté glóby, Cruise kvůli porotě vrací trofeje

Americká televize NBC nebude příští rok vysílat slavnostní předávání Zlatých glóbů. Rozhodla se tak po vlně...

Zatím jsem spíš studentka než modelka, říká šestnáctiletá dcera Kubelkové

Ivu Kubelkovou (44) si všichni pamatují první vicemiss roku 1996 a několikanásobnou vítězku ankety o nejkrásnější...

Twitch se stává Pornhubem pro děti, zaplavily ho streamerky v bikinách

Streamovací služba Twitch má poměrně přísná pravidla pro zobrazování sexuálního obsahu, některé uživatelky v nich však...

Ideální počet sexuálních partnerů existuje, ale opravdu ho chcete znát?

Tři jsou málo a osmnáct je moc. Nevíte, kde mají hranice ostatní a vlastně ani netušíte, jak si udělat obrázek o tom,...