Získal inženýrský titul na Vysoké škole dopravy a spojů v Žilině. Od roku 1987 pracoval jako vedoucí údržby dopravy v Přerovských chemických závodech.
Po čtyřech letech založil vlastní podnik – Omega servis s.r.o. se zaměřením na mezinárodní dopravu a zasílatelství. Zastával zde pozici předsedy představenstva a později generálního ředitele.
Ve Sdružení automobilových dopravců Česmad Bohemia pracoval v několika obdobích na různých vedoucích pozicích – viceprezident pro dopravu na vlastní účet (1995-98), člen předsednictva a předseda komise pro přepravy nebezpečných věcí (2001- 04) a viceprezident pro nákladní dopravu (2010-11).
Již v letech 2002-04 se přiblížil k politické činnosti, když radil Podvýboru pro dopravu Poslanecké sněmovny PČR. V lednu 2014 jej Andrej Babiš navrhl do Sobotkovy vlády, Prachař dostal přednost před poslancem za ANO Martinem Kolovratníkem a šéfem Řízení letového provozu Janem Klasem.
Po rezignaci ho v prosinci 2014 v čele resortu dopravy vystřídal Dan Ťok.
Na rozdíl od většiny ministrů neměl poslanecký mandát. V senátních volbách v říjnu 2014 kandidoval na Přerovsku, ale ve druhém kole prohrál s bývalou zástupkyní ombudsmana Jitkou Seitlovou kandidující za koalici lidovců a Strany zelených. O šest let později ve stejném obvodu neuspěl v prvním kole senátních voleb.
