Malá Lise spatřila světlo světa 7. listopadu roku 1878 ve Vídni, tehdejším hlavním městě Rakouska-Uherska. Narodila se do prostředí, které jako by předurčovalo její budoucí vědeckou dráhu. Pocházela z poměrně zámožné a kultivované rodiny, která jí zajistila nejen bezstarostné dětství, ale později taky ideální podmínky ke studiu všeho, co ji zajímalo. V dospělosti často s láskou vzpomínala na „neobvyklou dobrotu rodičů a mimořádně stimulující intelektuální atmosféru“, v níž spolu se svými bratry a sestrami vyrůstala.
Zpočátku jí například nevadilo, že se Hahn podepisoval i pod její vlastní výzkumy, takže to časem začalo budit dojem, že mu dělá pouhou asistentku.
