Čtvrtek 6. května 2021, svátek má Radoslav
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Čtvrtek 6. května 2021 Radoslav

Důkladně protřepat, prozkoumat křivky. Proč vyhodnocení vzorku trvá hodiny

  8:45
Zhruba pět hodin zabere v průměru vyhodnocení, zda vzorek stěru pacienta obsahuje nový typ koronaviru. „Nezdá se to, ale jedná se o velmi precizní, pečlivou a náročnou práci,“ vysvětluje brněnský lékař Filip Růžička, který se analýzou vzorků zabývá.

Filip Růžička se jakožto přednosta Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně zabývá vyhodnocováním vzorků pacientů s podezřením na koronavirus. | foto: FNUSA

Testování vyžaduje důkladné proškolení laborantů, aby si osvojili všechny potřebné kroky a prováděli je automaticky. Přesto si nemohou dovolit polevit v koncentraci a sklouznout do rutiny.

„Jde o úkony, které vyžadují preciznost a pečlivost. Zásadní je zde perfektní ovládnutí celého postupu tak, aby nedocházelo k chybám. Zároveň je však třeba udržet pozornost, aby bylo vše pod kontrolou,“ oznamuje Filip Růžička, který je přednostou Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně, jenž vyhodnocuje stěry pacientů.

Filip Růžička se jakožto přednosta Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně zabývá vyhodnocováním vzorků pacientů s podezřením na koronavirus.

Ty se k laboratorním expertům dostávají ve formě speciálních tamponů, zanořených v odběrovém médiu. Prvním úkonem je kontrola, zda nedošlo ke znehodnocení vzorků, a také prověření průvodních informací.

„Poměrně zdlouhavou úvodní částí naší práce je vybalení vzorků z trojobalu, jejich roztřídění a izolace dle typu vzorku a jejich počtu. Vše poté musíme zadat do informačního systému,“ přibližuje Růžička.

Teprve poté přichází na řadu samotná laboratorní fáze. Vzorek se protřepe, aby se z tamponu uvolnily případné virové částice, poté následuje samotná izolace.

„Používá se buď ruční izolace RNA (ribonukleové kyseliny), nebo může probíhat v automatickém izolátoru, který má však omezenou kapacitu a v současné době jsou také problémy s dostupností izolačních souprav na tyto přístroje,“ líčí Růžička.

Při ruční izolaci je vzniklá suspenze (směs pevné látky v kapalině) přemístěna pipetou do nové zkumavky, kam se přidá lyzační roztok a vzorek je znovu protřepáván, aby se rozrušily virové částice a uvolnily nukleové kyseliny.

Každá chyba může test pokazit

Vzniklý lyzát je přefiltrován přes speciální membránu, na níž se nukleové kyseliny navážou. Pak se přidá roztok, do kterého se přečištěná nukleová kyselina uvolní.

„V průběhu celého procesu je potřeba pracovat precizně, zejména je třeba důkladně a intenzivně vzorek protřepávat, dodržovat všechny předepsané inkubační časy a přesně pipetovat. Jakákoliv chyba se může projevit v kvalitě reakce,“ upozorňuje Růžička, že v tom případě by mohl vyjít špatný výsledek.

Zmíněná izolace zabere přes hodinu, ale v případě většího počtu vzorků trvá i výrazně déle. Zjednodušené postupy jsou sice kratší, ale také méně účinné a kvalitní.

„Následuje přenesení roztoku, obsahujícího přečištěnou RNA, do zkumavky s reakční směsí samotné RT-PCR (reakce, která v konečném důsledku vede k mnohonásobnému zmnožení nukleové kyseliny a ta je následně detekována). Zkumavka je poté vložena do přístroje, takzvaného thermocycleru, u něhož nastavujeme teploty, časy i počty cyklů,“ popisuje Růžička.

Analýza pak trvá opět déle než hodinu. „Následuje hodnocení výsledků dle charakteru křivek; ověření, jestli fungují všechny kontroly a posouzení, jestli je reakce validní. Výsledky musíme zapsat do laboratorního nemocničního informačního systému,“ sděluje Růžička. Pozitivní vzorky jsou poté okamžitě hlášeny.

Při celé operaci musí lidé v laboratoři dbát na svou bezpečnost a zároveň správnost procesu.

„Také laboratorní pracovníci jsou vystaveni velkému stresu a ne všichni mají stejnou psychickou a fyzickou odolnost. I oni mají obrovskou zodpovědnost v rámci celého procesu boje s novým koronavirem SARS-CoV-2,“ podotýká přednosta mikrobiologického ústavu.

Autor:
  • Nejčtenější

Tělo nalezené v řece patří hledanému mladíkovi, potvrdili policisté

Tělo, které se v úterý odpoledne objevilo ve vodách brněnské Svratky, patří pohřešovanému chlapci, potvrdili policisté....

Nastoupil, ale už nevystoupil. V Brně pátrají po muži, který zmizel z lodi

Brněnští policisté od neděle pátrají po muži, který se záhadně „vypařil“ z parníku na zdejší přehradě. Asi padesátiletý...

Ve 43 letech zemřel bývalý člen Janáčkovy opery v Brně Petr Císař

Minulý týden zemřel bývalý člen Janáčkovy opery v Brně Petr Císař. Bylo mu 43 let. O jeho úmrtí informovalo Národní...

Nevídaný flastr: vedení Brna napařilo hráčům pokutu jeden a půl milionu korun

K radikálnímu a naprosto ojedinělému kroku sáhlo před finišem záchranářských bojů ve fotbalové Fortuna lize vedení...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Vezu červený fosfor, řekl muž. Hasiči ho našli v obalu od Kinder vajíčka

Červený fosfor v obalu od Kinder vajíčka našli policisté při dopravní kontrole v neděli večer u řidiče v Gajdošově...

Pochvaly bych výrazně omezil, víc berou než dávají, vysvětluje psycholog

Premium Stále více čelíme nezdravému tlaku, abychom byli úspěšnější a výkonnější. Jak budovat zdravé sebevědomí? Jak správně...

Opakovaný výstup na osmitisícovku může urychlit demenci, říká neurochirurg Beneš

Premium Špičkový neurochirurg Vladimír Beneš, už třetí v řadě slavné neurochirurgické dynastie, o šťourátku v mozku, hezkých...

Pohodlnější to nikdy nebylo. Velký přehled služeb televize přes internet

Premium Otestovali jsme devět služeb televize přes internet. Vybrali jsme ty, které můžete používat s libovolným poskytovatelem...

  • Další z rubriky

Hledaného muže, který zmizel z lodi, našli utopeného v Brněnské přehradě

Policejní potápěči našli v pondělí večer v Brněnské přehradě v asi desetimetrové hloubce tělo muže, po kterém pátrali...

Turisté ve Znojmě dostali loni za útratu odměnu, výhody je čekají i letos

Stačí přespat v hotelu, dát si zákusek nebo víno a člověk už si odnáší poukázku na prohlídku města, podzemí nebo...

Na Brněnskou přehradu přepravili první lodě pomocí tramvaje a tanků

Nikde jinde v Česku netrvá plavební sezona tak dlouho a hladinu nebrázdí tolik lodí veřejné dopravy. Ta na Brněnské...

Ze Svratky v Jundrově policie vylovila tělo. Zatím neví, komu patří

Z řeky Svratky v brněnském Jundrově dnes vytáhli tělo. Podle policie nyní probíhá jeho identifikace a možná už ve...

Absolonová oznámila rozchod s Hornou. Bohužel i to je život, vzkázala

Monika Absolonová (44) na sociálních sítích oznámila, že se rozešla s partnerem Tomášem Hornou (40). Důvodů podle ní...

Máte jeden z těchto mobilů? Brzy si s ním na mobilním internetu neškrtnete

Letošek je v Česku ve znamení vypínání sítí postavených na zastaralé 3G technologii. Jako poslední ji koncem listopadu...

Kristelová žaluje Novotného. Za zničenou kariéru chce půl milionu

Soud začal projednávat žalobu Kateřiny Kristelové na Pavla Novotného. Moderátorka tvrdí, že jí někdejší bulvární...

Nová Škoda Fabia odhalena, ceny startují na 330 tisících

Škoda odhalila v online světové premiéře čtvrtou generaci modelu Fabia. Automobilka také zveřejnila základní cenu...

KOMENTÁŘ: Konec legrace, teď začne pořádné zdražování

Postupné zpomalování růstu cen, které v Česku probíhalo od loňského července, je u konce. V březnu byla inflace na...