Sobota 17. dubna 2021, svátek má Rudolf
  • schránka
  • Přihlásit Můj účet
  • Sobota 17. dubna 2021 Rudolf

Důkladně protřepat, prozkoumat křivky. Proč vyhodnocení vzorku trvá hodiny

  8:45
Zhruba pět hodin zabere v průměru vyhodnocení, zda vzorek stěru pacienta obsahuje nový typ koronaviru. „Nezdá se to, ale jedná se o velmi precizní, pečlivou a náročnou práci,“ vysvětluje brněnský lékař Filip Růžička, který se analýzou vzorků zabývá.

Filip Růžička se jakožto přednosta Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně zabývá vyhodnocováním vzorků pacientů s podezřením na koronavirus. | foto: FNUSA

Testování vyžaduje důkladné proškolení laborantů, aby si osvojili všechny potřebné kroky a prováděli je automaticky. Přesto si nemohou dovolit polevit v koncentraci a sklouznout do rutiny.

„Jde o úkony, které vyžadují preciznost a pečlivost. Zásadní je zde perfektní ovládnutí celého postupu tak, aby nedocházelo k chybám. Zároveň je však třeba udržet pozornost, aby bylo vše pod kontrolou,“ oznamuje Filip Růžička, který je přednostou Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně, jenž vyhodnocuje stěry pacientů.

Filip Růžička se jakožto přednosta Mikrobiologického ústavu Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně zabývá vyhodnocováním vzorků pacientů s podezřením na koronavirus.

Ty se k laboratorním expertům dostávají ve formě speciálních tamponů, zanořených v odběrovém médiu. Prvním úkonem je kontrola, zda nedošlo ke znehodnocení vzorků, a také prověření průvodních informací.

„Poměrně zdlouhavou úvodní částí naší práce je vybalení vzorků z trojobalu, jejich roztřídění a izolace dle typu vzorku a jejich počtu. Vše poté musíme zadat do informačního systému,“ přibližuje Růžička.

Teprve poté přichází na řadu samotná laboratorní fáze. Vzorek se protřepe, aby se z tamponu uvolnily případné virové částice, poté následuje samotná izolace.

„Používá se buď ruční izolace RNA (ribonukleové kyseliny), nebo může probíhat v automatickém izolátoru, který má však omezenou kapacitu a v současné době jsou také problémy s dostupností izolačních souprav na tyto přístroje,“ líčí Růžička.

Při ruční izolaci je vzniklá suspenze (směs pevné látky v kapalině) přemístěna pipetou do nové zkumavky, kam se přidá lyzační roztok a vzorek je znovu protřepáván, aby se rozrušily virové částice a uvolnily nukleové kyseliny.

Každá chyba může test pokazit

Vzniklý lyzát je přefiltrován přes speciální membránu, na níž se nukleové kyseliny navážou. Pak se přidá roztok, do kterého se přečištěná nukleová kyselina uvolní.

„V průběhu celého procesu je potřeba pracovat precizně, zejména je třeba důkladně a intenzivně vzorek protřepávat, dodržovat všechny předepsané inkubační časy a přesně pipetovat. Jakákoliv chyba se může projevit v kvalitě reakce,“ upozorňuje Růžička, že v tom případě by mohl vyjít špatný výsledek.

Zmíněná izolace zabere přes hodinu, ale v případě většího počtu vzorků trvá i výrazně déle. Zjednodušené postupy jsou sice kratší, ale také méně účinné a kvalitní.

„Následuje přenesení roztoku, obsahujícího přečištěnou RNA, do zkumavky s reakční směsí samotné RT-PCR (reakce, která v konečném důsledku vede k mnohonásobnému zmnožení nukleové kyseliny a ta je následně detekována). Zkumavka je poté vložena do přístroje, takzvaného thermocycleru, u něhož nastavujeme teploty, časy i počty cyklů,“ popisuje Růžička.

Analýza pak trvá opět déle než hodinu. „Následuje hodnocení výsledků dle charakteru křivek; ověření, jestli fungují všechny kontroly a posouzení, jestli je reakce validní. Výsledky musíme zapsat do laboratorního nemocničního informačního systému,“ sděluje Růžička. Pozitivní vzorky jsou poté okamžitě hlášeny.

Při celé operaci musí lidé v laboratoři dbát na svou bezpečnost a zároveň správnost procesu.

„Také laboratorní pracovníci jsou vystaveni velkému stresu a ne všichni mají stejnou psychickou a fyzickou odolnost. I oni mají obrovskou zodpovědnost v rámci celého procesu boje s novým koronavirem SARS-CoV-2,“ podotýká přednosta mikrobiologického ústavu.

Autor:
  • Nejčtenější

Bláznivý voyeur Tichý. Žil jako bezdomovec, dnes jeho fotky stojí statisíce

Premium V jeho domě se fotky válely po zemi, padal na ně prach i bláto z bot. Na téměř každé z nich byla skvrna od kávy nebo...

Žena v Brně zemřela po pádu ze sedmého patra, podle svědků umývala okna

Smrtelná zranění si přivodila žena, která v Brně vypadla ze svého bytu v sedmém patře paneláku. Snaha záchranářů o...

Grepl: Kdo řekne covidu rýmička, toho zbiju. Hrachovina je blb

Když mluvil o koronaviru, se kterým svedl těžký zápas, oči se mu leskly a v povídání si musel dávat pauzy. Zasáhlo ho...

Zloděj ukradl ze zahrady celý domek, majiteli zůstal jen nábytek a základy

Majitel zahrady nedaleko Staroviček na Břeclavsku našel po víkendu místo zahradního domku jen základy a nábytek....

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

Afrika není jen chudá, ale i moderní, líčí „česká Afričanka“ tamní život

Premium Do Afriky ji to nikdy netáhlo, ale i přesto jí propadla. Češka Zuzana Mukumayi Filipová na „černém kontinentu“ žije již...

Bláznivý voyeur Tichý. Žil jako bezdomovec, dnes jeho fotky stojí statisíce

Premium V jeho domě se fotky válely po zemi, padal na ně prach i bláto z bot. Na téměř každé z nich byla skvrna od kávy nebo...

Za fotky nehody Philipa nabízeli obří sumu. Neprodal jsem, říká exšéf Kladrub

Premium Když v roce 1996 přijela do Čech britská královna Alžběta II., snad nikdo nemohl velkému milovníkovi koní a jejich...

Svačiny jsou zbytečné. Stačí jíst dvakrát denně, vysvětluje profesor Anděl

Premium Nadváhu má v Česku až 44 procent mužů a 31 procent žen. A obezitu dalších 20 procent mužů a 18 procent žen. Statisíce z...

  • Další z rubriky

Nová čtvrť v Brně nabídne bydlení pro patnáct tisíc lidí, vznikne u nádraží

Plánovaná brněnská čtvrť Trnitá dostala jasné obrysy. Kancelář architekta města Brna (KAM) dokončila aktualizaci územní...

Pes vběhl za kočkou do kanalizace, s pomocí bagru je vytáhli hasiči

Psa uvázlého v kanalizaci zachraňovali hasiči v Mutěnicích na Hodonínsku. Z potrubí nakonec vytáhli i kočku, za kterou...

Žena v Brně zemřela po pádu ze sedmého patra, podle svědků umývala okna

Smrtelná zranění si přivodila žena, která v Brně vypadla ze svého bytu v sedmém patře paneláku. Snaha záchranářů o...

Firma od Brna bude jako první v Česku vyrábět ze starých PET lahví nové

Chtějí-li dnes výrobci nápojů v Česku využít při balení PET lahve, které vznikly recyklací těch starých, musejí hledat...

Úklid hotový raz dva! Přihlaste se o jeden z 10 mopů 1-2 Spray max od Viledy
Úklid hotový raz dva! Přihlaste se o jeden z 10 mopů 1-2 Spray max od Viledy

Čistá podlaha snadno a rychle? 1-2 Spray max se perfektně hodí na rychlý každodenní úklid, kdy se vám nechce tahat s těžkým kbelíkem vody. Které...

Princ Harry se vrátil do Británie na pohřeb dědečka, karanténu nestihne

Britský princ Harry přiletěl z Los Angeles na pohřeb svého dědečka prince Philipa. Na letišti Heathrow ho v neděli po...

Je to podraz, říká organizátor koncertů Cesta ze tmy. S projektem končí

Už za týden měl prostory pražské Lucerny rozeznít první koncert ze série Cesta ze tmy. Ministr zdravotnictví Petr...

Pohřbít psa na zahradě? Splnit podmínky vyhlášky je téměř nemožné

Chov zvířecího mazlíčka nepřináší jen radosti. Každý bude muset jednou řešit otázku kam s ním, až život jeho čtyřnohého...

U takové svi.. nemusím být inteligentní. Ve Výměně se vyhrožovalo rozvodem

V jedné rodině pohoda, ve druhé napětí a tichá domácnost. Pavlovi s vyměněnou manželkou došlo, že doma může být dobře....

Karel neskrýval, že chce syna, prozradila těhotná Lilia Khousnoutdinova

Lilia Khousnoutdinova (32) a Karel Janeček (47) se za pár týdnů dočkají miminka. Publicistka, návrhářka a cestovatelka...