Za kontroverzním návrhem stojí část ekologů a odborníků, podle nichž by obnovené lužní lesy přinesly přírodě větší užitek než současné přehrady. S tím ale nesouhlasí vodohospodáři, mnozí starostové okolních obcí i provozovatelé kempů. Upozorňují, že nádrže mají zásadní význam pro ochranu před povodněmi, hospodaření s vodou i cestovní ruch.
Pokud někdo říká, že jsou Nové Mlýny nezbytné kvůli povodním, pak bych upozornil, že suchý poldr může být z hlediska protipovodňové ochrany efektivnější než trvale napuštěná nádrž.
